Após o descobrimento, em 1502, várias expedições exploradoras e aventureiras foram realizadas no litoral brasileiro. Com isso, significante número de registros históricos foram manuscritos e falando especificamente da Ilha Grande, iniciamos por volta de 1552.

A Ilha Grande fazia parte da nação dos índios Tamoios, que se estendia de Cabo Frio ( litoral norte do RJ ) até as proximidades de Ubatuba ( litoral norte de SP ) , onde fazia fronteira com as terras dos índios Guaianás-Guaranis , que habitavam o sul da América do Sul.

Ilha Grande já era assim chamada pelos índios Tamoios, que na língua Tupi era Ipaum Guaçu. Ipaum significa Ilha e Guaçu significa Grande. Esse registro deve-se ao aventureiro alemão Hans Staden, que assim o registrou nos mapas publicados em sua obra em 1557. Padre Anchieta, o famoso catequista dos índios brasileiros, também registrou a presença dos Tamoios na Ilha. Segundo Anchieta, eles viviam em aldeias com cerca de seis ocas, totalizando aproximadamente 150 habitantes. Eram valentes guerreiros, ótimos flecheiros, caçadores, pescadores de linha e mergulho e viviam de modo distinto dos outros indígenas do continente, além de terem a sua linguagem também diferente.

A vegetação - mata atlântica, semelhante a da Serra do Mar, conservou-se apenas nas montanhas , devido à topografia íngreme dos topos que fez com que , nos séculos que se seguiram, o machado dos navegantes destruísse a flora da periferia, impedindo assim que o homem as destruísse por completo. Registros históricos descrevem as florestas da Ilha Grande como as mais bonitas do início da colonização pois, estas chegavam até a beira do mar. Haviam troncos de árvores de descomunal tamanho. Laranjeiras e limoeiros nasciam e cresciam, por dádiva da natureza. As matas eram muito densas, dificultando a caça e naquela época, eram habitadas , em grande população, por jacarés, lagartos , macacos (ainda existem vários bandos) , ouriços, pacas, jaguatiricas, gambás, ratos e jararacas.